Kebijakan tertulis dalam bentuk peraturan perundang-undangan dan/atau peraturan pimpinan perguruan tinggi yang mengatur pemerolehan, pengelolaan, dan penggunaan dana untuk kegiatan pendidikan, penelitian, dan PkM di UPPS. Kebijakan pengelolaan keuangan, sarana dan prasarana yang ditetapkan pada IAIN Madura tersebut dikembangkan lebih lanjut oleh Fakultas Tarbiyah untuk menjadi dasar implementasi pada Program Sarjana MPI. Berikut beberapa dokumen formal yang menjadi panduan pengelolaan keuangan, sarana, dan prasarana, pada Program Sarjana MPI.

1. Peraturan Menteri Agama Republik Indonesia Nomor 1195 Tahun 2019 Tentang Uang Kuliah Tunggal Pada Perguruan Tinggi Keagamaan Negeri Di Kementerian Agama Tahun 2020-2021
2. Peraturan Menteri Agama Republik Indonesia Nomor 176 Tahun 2021 Tentang Uang Kuliah Tunggal Pada Perguruan Tinggi Keagamaan Negeri Di Kementerian Agama Tahun 2021-2022
3. Peraturan Menteri Agama Republik Indonesia Nomor 244 Tahun 2022 Tentang Uang Kuliah Tunggal Pada Perguruan Tinggi Keagamaan Negeri di Kementerian Agama Tahun 2022-2023
4. Peraturan Menteri Keuangan Republik Indonesia Nomor 78 /PMK.02/2019 Tentang Standar Biaya Masukan (SBM) Tahun Anggaran 2020
5. Peraturan Menteri Keuangan Republik Indonesia Nomor 119/PMK.02/2020 Tentang Standar Biaya Masukan (SBM) Tahun Anggaran 2021
6. Peraturan Menteri Keuangan Republik Indonesia Nomor 60/PMK.02/2021 Tentang Standar Biaya Masukan (SBM) Tahun Anggaran 2022
7. Keputusan Dekan Fakultas Tarbiyah IAIN Madura Nomor: B-1456/In.38/FT/KP.00.3/12/2021 tentang Rencana Strategis Program Studi (PS) Manajemen Pendidikan Islam Tahun 2021-2025
8. Kebijakan Rektor IAIN Madura nomor B-2382/In.32/PP.00.1/03/2022 tentang Pedoman Pengelolaan Keuangan di IAIN Madura
9. Keputusan Rektor IAIN Madura Nomor B-2392/In.33/PP.00.7/06/2022 tentang Pedoman Penetapan Biaya Pendidikan di IAIN Madura
10. Keputusan Rektor IAIN Madura Nomor Nomor: B-2379/In.37/PP.00.4/05/202 tentang Pedoman Perencanaan Anggaran di IAIN Madura
11. Kebijakan Rektor IAIN Madura nomor B-1042/In.38/R/OT.01.3/ 08/2020 tentang Sistem Penjaminan Mutu Internal (SPMI)
12. Keputusan Rektor IAIN Madura Nomor: B-1045/In.38/R/OT.01.3/08/2020 tentang Pedoman Audit Mutu Internal
13. Keputusan Rektor IAIN Madura Nomor: B.1697a/In.38/PP.00.9/08/2019 tentang Pedoman Pendidikan Program Sarjana
14. Keputusan Rektor IAIN Madura Nomor B-2398/In.33/PP.00.8/07/2022 tentang Biaya Publikasi Jurnal
15. Keputusan Rektor IAIN Madura Nomor : B-2387/In.38/PP.00.9/06/2022 tentang Pedoman Pengelolaan Sarana dan Prasarana Pembelajaran, Penelitian, serta Pengabdian Kepada Masyarakat